北海道色のキハ40-301
北海道色のキハ40-1806
北海道色のキハ40-401
日高線色のキハ40-357
初代五能線色のキハ40-553
五能線色のキハ40-529
男鹿線色のキハ40-1006
盛岡色のキハ40-555
左沢線色のキハ40-578
新潟色のキハ40-560
新新潟色のキハ40-586
宇都宮色のキハ40-1001
烏山線色のキハ40-1007
広島色のキハ40-2002
只見線色のキハ40-2022
水郡線色のキハ40-2026
東海色のキハ40-2111
エンジン交換し冷房化された東海色のキハ40-3306
城端線・氷見線観光列車「ベル・モンターニュ・エ・メール」"べるもんた"塗装のキハ40-2027
姫新線色のキハ40-2034
首都圏色のキハ40-2044
加古川線色のキハ40-2029
加古川線色のキハ40-2092
境港線 ヨットデザインのキハ40-2094
第二次高岡色のキハ40-2137
九州色のキハ40-2128
九州色で屋根の上のタンクとトイレの換気窓の撤去されたキハ40-8069
日南色で屋根の上のタンクとトイレの換気窓の撤去されたキハ40-8097
「ふるさと」「月 (GETSU)」（旧キロ40 1）のキハ40-2501
越乃ShuKuraのキハ40-552
キハ40-764号機を『鉄道員ぽっぽや』の撮影のため、キハ12に似せるため改造されたキハ12-23
